Az alapszakasz kezdete előtt több szakértő is az NFC West legnagyobb esélyesének, ezáltal jövőbeni playoff résztvevőnek vizionálta a San Francisco 49ers csapatát. Az elvárásoknak azonban - mint utóbb kiderült - a legkevésbé sem tudtak megfelelni. A szezont 5 vereséggel kezdő 'Frisco-iak év végére is csak 6-10-re tudták "szépíten" győzelem-vereség mutatójukat, így a nem túl acélosnak tartott csoport 3. helyén találták magukat, immár 8. éve távolmaradva a postseason küzdelmeitől. A bűnbak hamar megtaláltatott. A vezetőség még az utolsó forduló előtt kiadta Mike Singletary vezetőedző útját, aki két és fél szezonon kersztül töltötte be a pozíciót. Helyét ideiglenesen - egyetlen mérkőzésre - Jim Tomsula védőfal edzőre bízták. A hosszútávú megoldásra nem kellett sokat várni, január 7-én ugyanis Jim Harbaugh elfogadta az 5 évre szóló főedzői állásajánlatot.
A '63 december 23-án született James Joseph "Jim" Harbaugh - egykori ('87) chicago-i elsőkörös választottként - 15 évet húzott le a profik közt, olyan csapatok tagjaként, mint a Bears, Colts, Ravens, Chargers, Phanters. 177 mérkőzésén (140-en kezdőként) 26.288 passzolt yard mellett 129 TD-t osztott ki. 3.918 passzából 2.305 találta meg célját, mely kategóriákban egyaránt az NFL történetének 50 legjobbja között szerepel (45. és 41.). Harbaugh - fiatal kora ellenére - már 17 éves edzői tapasztalattal rendelkezik. Még aktív játékosként egyfajta segédedzőként dolgozott apja, Jack Harbaugh mellett a Western Kentucky egyetemen, ahol fiatal tehetségek felkutatása volt egyik fő feladata. Visszavonulása után 2 évig az Oakland Raiders alkalmazásában állt, mint offense segédedző, majd QB edző. 2004-től 3 évig volt főedzője a University of San Diego-nak, ahol utolsó 2 évében egyaránt 11-1-es szezonnak, és Pioneer League győzelemnek örülhetett. 2006 decemberében került utolsó (vagy csak legutóbbi? :-) egyetemi állomására, a Stanford University-re. Vezetőedzőként 4 év alatt - egy 1-11-es szezon után kezdve munkáját - 2010-re 11-1-es évet zárt a Cardinal, mely után az iskola történetében először győzedelmeskedtek egy BCS bowl-on, az Orange Bowl-on.
Imponáló múlt, megfelelőnek tűnő játékosállomány, egy teljes offseason... Jó munkát Mr. Harbaugh!
